A diferencia de la Curiyú (Eunectes notaeus), que puede habitar en zonas abiertas de tipo sabana, la Mboi yagua se restringe fundamentalmente a las selvas no alteradas.

Este animal posee dientes macizos - carentes de canales conductores de veneno- que solo sirve para detectar a las presas mientras las envuelve con sus poderosos anillos hasta estrangularla y engullirlas enteras.

Acostumbra a alimentarse debajo del agua y sus presas principales son peces, anfibios, reptiles, aves y mamíferos pequeños o medianos. Así como la Mboi yagua devora a estos animales, a su vez sirve de alimentos a rapaces, felinos, otros ofidios como la ñacanina, y yacarés, principalmente cuando son aun pequeñas; pero su principal depredador es el hombre, que la caza indiscriminadamente por su bella piel.

Su ciclo sexual es anual, es decir que pueden procrear una vez al año. Luego de un cortejo, que puede tener lugar tanto en el agua como en la tierra, se realiza la copula, que puede durar unas 9 horas. Durante 4 o 5 meses de gestación nacen entre 2 y 20 crías vivas, pues son ovovivíparas, de coloración similar a la de sus padres y de una longitud entre 40 y 78 cm.

En el Paraguay se encuentra únicamente al norte de la Región Oriental, siendo menos común que su pariente, la Curiyú, que se la puede observar en todo el país. Ambas están en serio peligro de desaparecer.